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毒胡萝卜素和衣霉素导致INS-1细胞内质网应激的数字基因表达谱分析
作者:刘瑜婷|李世蕊|宋璐璐|王在|肖建中 来源:中日友好医院内分泌科|中日友好医院临床医学研究所病理生理研究室|北京清华长庚医院内分泌科 浏览次数:0次
目的 内质网应激是细胞对高血糖的适应性反应,也是导致细胞凋亡和功能衰竭的重要因素。本文通过药物毒胡萝卜素(TG)和衣霉素(TM)造成β细胞应激,探索内质网应激后导致功能改变或凋亡所涉及的主要信号通路和分子。

方法 以正常培养的INS-1细胞为对照(Con),通过TG0.1μM,16小时)和TM2.5μg/ml16小时)建立内质网应激模型。每个模型收集3个样本,进行数字基因表达谱分析,分析各组与对照组基因表达的差异,并进行信号通路富集分析。
结果 TG组和TM组分别进行real-time PCR、凋亡检测,证实β细胞内质网应激模型建立成功。TG组和TM组分别与对照组比较,采用NOIseq方法,以probability≥0.8log2Ratio≥1为标准,筛选出的差异基因数目分别为57个(上调基因45个,下调基因12个)和135个(上调基因99个,下调基因36个)。以KEGG为单位,应用超几何检验进行pathway富集分析,发现差异基因富集的相同的信号通路包括:Protein processing in endoplasmic reticulumMaturity onset diabetes of youngMODY)。在MODY信号通路中,TG组和TM组均出现下调的基因包括NK2 homeobox 2(分别降低至0.530.44)、NK6 homeobox 1(分别降低至0.460.55),上调的基因为basic helix-loop-helix family, member a15(分别升高至3.73.84)。real-time PCR验证实验也证实了这些改变。
结论 MODY信号通路相关分子大部分是胰岛细胞发育和功能维持相关转录因子,在内质网应激的情况下,这些转录因子表达发生变化导致胰岛β细胞功能发生变化。

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