方法 以正常培养的INS-1细胞为对照(Con),通过TG(0.1μM,16小时)和TM(2.5μg/ml,16小时)建立内质网应激模型。每个模型收集3个样本,进行数字基因表达谱分析,分析各组与对照组基因表达的差异,并进行信号通路富集分析。
结果 TG组和TM组分别进行real-time
PCR、凋亡检测,证实β细胞内质网应激模型建立成功。TG组和TM组分别与对照组比较,采用NOIseq方法,以probability≥0.8和∣log2Ratio∣≥1为标准,筛选出的差异基因数目分别为57个(上调基因45个,下调基因12个)和135个(上调基因99个,下调基因36个)。以KEGG为单位,应用超几何检验进行pathway富集分析,发现差异基因富集的相同的信号通路包括:Protein processing in endoplasmic
reticulum和Maturity onset diabetes of young(MODY)。在MODY信号通路中,TG组和TM组均出现下调的基因包括NK2 homeobox 2(分别降低至0.53和0.44)、NK6
homeobox 1(分别降低至0.46和0.55),上调的基因为basic
helix-loop-helix family, member a15(分别升高至3.7和3.84)。real-time PCR验证实验也证实了这些改变。
结论 MODY信号通路相关分子大部分是胰岛细胞发育和功能维持相关转录因子,在内质网应激的情况下,这些转录因子表达发生变化导致胰岛β细胞功能发生变化。